Muchas de las actividades del CONICET se encuentran respaldadas en acuerdos explícitos con contrapartes nacionales e internacionales. Estos convenios pueden diferenciarse en Convenios Marco y Convenios Específicos.

Los Convenios Marco establecen las condiciones generales de colaboración entre las partes. Asimismo, dentro de esta categoría se encuentran los Convenios Marco de Creación de Unidades Ejecutoras de doble o múltiple dependencia.

Los Convenios Específicos establecen un objeto específico, las tareas a desarrollar, las obligaciones asumidas por cada una de las partes y el plazo de ejecución de las mismas. En esta categoría se incluyen los Convenios de Radicación, para cofinanciar proyectos de investigación, de Comodato, de colaboración científica, entre otros.